单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级分子进化分析与相关进化模式例子分子进化分析介绍系统发育树重建方法相关进化模式例子从物种的一些分子特性出发从而了解物种之间的生物系统发生的关系 蛋白和核酸序列通过序列同源性的比较进而了解基因的进化以及生物系统发生的内在规律分子进化研究的目的系统发育树是什么对一组实际对象的世系关系的描述(如基因物种等)
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级分子进化分析—— 系统发生树的构建主要内容分子进化分析介绍系统发育树建立方法系统发育树构建实例分子进化分析介绍系统发生(phylogeny)——是指生物形成或进化的历史 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系 系统发育树(phylogenetic tree)——描
构建系统发育树需要注意的几个问题1 相似与同源的区别:只有当序列是从一个祖先进化分歧而来时它们才是同源的2 序列和片段可能会彼此相似但是有些相似却不是因为进化关系或者生物学功能相近的缘故序列组成特异或者含有片段重复也许是最明显的例子再就是非特异性序列相似3 系统发育树法:物种间的相似性和差异性可以被用来推断进化关系4 自然界中的分类系统是武断的也就是说没有一个标准的差异衡量方法来定义种属科或
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级序列拼接序列提交系统发育树构建非克隆测序结果拼接535反向互补序列ABC3ACDNAMAN软件实现序列拼接双向测序结果中一条链反向互补序列的获得拼接反向互补序列的获得序列导入反向互补序列的获得序列拼接序列拼接序列拼接序列提交(以BankIt为例):.ncbi.nlm.nih.gov系统发育树的构建Blast 获得