miRNA靶基因预测数据库归纳1 TargetScanTargetScan数据库是大家比较常用的预测miRNA靶基因数据库,主要通过搜索和每条miRNA种子区域匹配的保守的8mer和7mer位点来预测靶基因。该数据库提供人、小鼠、大鼠、奶牛、狗、猩猩、恒河猴、负鼠、鸡和青蛙等动物信息。最新更新时间为2015年8月,版本为V70。链接:该数据库基于靶位点的可接性(target-site acces
miRNA-lncRNA关系预测数据库1.miRSponge数据库:2.RNA22:3.lncACTdb数据库:4.RAID v20数据库:5.DIANA Tools数据库:6.starBase数据库:7.mircode数据库8. LNCediting数据库9.LncRNASNP数据库10.lncrnamap数据库
miRNA相关数据库 :EVmiRNA(提供三个功能模块:(i)miRNA表达谱和来自不同来源(例如血液、母乳等)的EV的样品信息;(ii)不同EV中特异性表达的miRNA,有助于生物标志物鉴定;(iii)miRNA注释,包括EV和TCGA癌症类型中的miRNA表达,miRNA通路调节以及miRNA功能和出版物。EVmiRNA具有用户友好的Web界面,具有强大的浏览和搜索功能,以及数据下载。它是
1、siRNA数据库及设计工具siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ? Validated and Pre-designed siRNAs to 34,000 human, mouse, and rat targets All siRNAs in the database have been designed for maximum pote
miRNA靶基因鉴定文章来源:英格恩技术博客一、miRNA的靶基因寻找研究表明,一个基因可以受多个miRNA调控,而一种miRNA又可以参与调控多个靶基因,据预测,至少有30%的人类基因是miRNA的靶基因。这就足以显示出miRNA群体的重要性。而在人类疾病中多不同程度的表现出大量miRNA的上调和下调,这也足以显示miRNA在疾病发生过程中占据着非常重要的作用。而探讨miRNA的功能作用中最重
基因预测基因预测简介1)基础概念:(1)随机过程:一族无穷多个、相互有关联的随机变量。记为:{X (t),t∈T},由于参数t经常代表时间,故称为随机过程。T常为自然数,整数或区间。当参数取值为整数时,也称为随机序列。(2)马尔可夫过程:取值为整数的随机过程,若t=i时刻的取值只与时刻i-1取值有关,则称为马尔可夫过程,也称为一阶马尔可夫链。(3)隐马尔可夫模型(HMM):存在一个隐序列H,它
基因打靶(Gene targeting) (一)基因打靶的原理基因打靶(gene targeting)是根据DNA同源重组的原理而设计的一项技术。在这一技术中,体内细胞基因组的某一段DNA序列被视为“靶子”,经精巧构建的欲导入的外源基因DNA序列被视为“弹头”,这样导入的外源基因进入受体细胞后就不再是随机整合而是“弹头”锚准“靶子”进行准确的定点整合。 基因打靶的原理打靶载体(targeting
靶向药物基因检测药物名称相关靶标基因相关基因位点指导意义吉非替尼(易瑞沙)埃罗替尼(特罗凯)EGFR基因突变18192021外显子EGFR基因野生型患者疗效差EGFR基因突变型患者尤其是Exon19缺失型和Exon21突变型患者疗效显著增加Exon20如果790密码子发生突变可能出现继发性耐药KRAS基因突变121361密码子KRAS基因野生型患者疗效较好KRAS基因突变型患者疗效显著降低西
疾病基因研究室药物基因组研究中心生命科学研究院重庆医科大学药学院 秧茂盛 LDGLDG基因多态性数据库与运用 讲课内容三人类遗传物质的差异--基因多态性二导致人类表型多样性的原因四SNPs概论五SNPs数据库构建六SNPs实验分析技术七SNPs实验分析中的问题八实际工作中SNPs的选择原则一人类表型的多样性九SNPs数据库使用流程演示一人类表型的多样性遗传背景一致性和部分表型的差异二导致人类表型
35单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级35单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级35单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级35教师:王华单位:吉 林 大 学 基础医学院 分
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