phytochrome [Oryza sativa Indica Group]GenBank: =fastaFASTA =graphGraphicsLOCUS CAA32375 1128 aa linear PLN 14-NOV-2006DEFINITION phytochrome [Oryza sativa Ind
核酸序列查询方法1进入相应的数据库在芯片差异结果中的source中会显示对应RNA的来源库2以ENSRNOT00000053156为例打开ensembl数据库输入RNA编号点击搜索结果进入相应RNA信息界面3查看信息界面左侧中的cDNA栏如果是蓝色的就直接点击cDNA如果是灰色的则点击latest version对应的编号4点击进入后点击左侧的cDNA栏即可查到其序列信息5在其他数据库查询序列相对
核酸序列的一般分析流程 核酸序列的检索 :=Nucleotide t _blank :=Nucleotide 核酸序列的同源性分析 .1 基于NCBIBlast软件的核酸序列同源性分析 blastblast.cgi t _blank blastblast.cgi .2 核酸序列的两两比较 gorfbl2 t _blank gorfbl2 .3 核酸序列
实验七 核酸序列分析一实验目的1.掌握采用相关软件分析核酸序列分子质量碱基组成及碱基分布等2.掌握核酸序列变换的分析方法3.掌握核酸序列限制性酶切分析方法4.了解引物设计的基本知识5.了解NCBI序列信息提交方法学习运用Bankit进行序列提交6.了解构建系统发育树的基本方法二实验内容及操作程序(一)DNAMAN的安装和基本操作1.下载安装DNAMAN软件2.使用Entrez信息查询系统检索一条你
发现重复元素序列翻译与开放阅读框(ORF)预测ORF辨别的基本方法 (1) 利用编码区所具有的独特信号比如起始密码子终止密码子等进行识别检查终止密码子的出现频率 基本思想: 如果能够找到一个比较长的序列其相应的密码子序列不含终止密码子则这段序列可能就是编码区域基本算法: 扫描给定的DNA序列在三个不同的阅读框中寻找较长的ORF遇到终止密码子以后回头寻找起始密码子 这种算法过
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各种碱基数量各种碱基比例AAAAAUGGCCAUGGGUCCACACGCAGUGAGAUGAAUGCUAGAUCUCACGAGA在Tool网页选择Nucleic Tools→Nucleic Translation →Transeq点击Launch打开要分析序列的文件并copy序列在BioEdit分析工具的File栏目选择New from Clipboard粘贴序列分析方法(举例)Forward e
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我这有的是氨基酸序列这个也可以设计引物的周一来吧以下的ORF1代表RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase RdRp 220 kDa)ORF234代表三基因连锁结构(triple gene block TGB 25 kDa 12 kDa 7 kDa)ORF5代表外壳蛋白(coat protein CP 32 kDa)[55-56]和ORF6代表一个功能尚不
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