实习 5 : 蛋白质结构预测 20090 专业年级 生命生技 实验时间 提交报告时间 实验目的:1.学会使用GOR和HNN方法预测蛋白质二级结构2.学会使用SWISS-MODEL进行蛋白质高级结构预测实验内容:分别用GOR和HNN方法预测蛋白质序列的二级结构并对比异同性
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第七章 蛋白质结构预测主讲人:孙 啸制作人: 刘志华东南大学 吴健雄实验室第一节 引言蛋白质结构预测问题 序列——结构——功能….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FUNCTION结构预测问题….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FUNCTION解决方法….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FU
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级蛋白质结构与功能预测2007年12月DNA sequenceProtein sequenceProtein structureProtein function蛋白质序列分析蛋白质一级序列蛋白质基本理化性质分析蛋白质亲疏水性分析跨膜区结构预测卷曲螺旋预测翻译后修饰位点预测蛋白质二级结构蛋白质二级结构预测蛋白质序列信号位点分析蛋白
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版
SWISS-MODEL 蛋白质结构预测 SWISS-MODEL是一项预测蛋白质三级结构的服务它利用同源建模的方法实现对一段未知序列的三级结构的预测该服务创建于1993年开创了自动建模的先河并且它是讫今为止应用最广泛的免费服务之一 同源建模法预测蛋白质三级结构一般由四步完成:从待测蛋白质序列出发搜索蛋白质结构数据库(如PDBSWISS-PROT等) 得到许多相似序列(同源序列)选定其中一
蛋白质结构与功能的预测蛋白质结构预测:蛋白质结构预测相关概念:?折叠(fold)的概念折叠(fold)是近年来蛋白质研究中应用较广的一个概念它是介与二级和三级结构之间的蛋白质结构层次它描述的是二级结构元素的混合组合方式二级结构的预测方法介绍:Chou-Fasman算法: ??? 是单序列预测方法中的一种它是使用氨基酸物理化学数据中派生出来的规律来预测二级结构 首先统计出20种氨基酸出现在α螺旋β折
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第五章 蛋白质结构预测第一节 引言蛋白质结构预测问题 序列——结构——功能….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FUNCTION结构预测问题….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FUNCTION解决方法….-Gly-Ala-Glu-Phe-….FUNCTION 寻找一种从蛋白质的氨基酸线性序列到蛋白质所有原
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级蛋白质二级结构预测软件蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全α蛋白全β蛋白αβ蛋白和αβ蛋白等四个折叠类型预测蛋白质二级结构的算法大多以已知三维结构和二级结构的
posite Structural Motifs of Binding Sites for Delineating Biological Functions of Proteins 汇报人:刘言 结构信息可以为蛋白质功能预测提供更加准确的信息 To date there have been many methods for detecting p
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