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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第五章分子动力学模拟 计算的应用本章内容运动轨迹分析热力学特性的计算径向分布函数相关函数的计算运动轨迹分析结构图像 (可视化图形软件)几何参量的时间关系曲线 (graceoriginexcel)键长:键角:二面角:两个面法线的交角法线向量方向:平面内非平行两向量的差乘误差分析 势能函数 可以在计算力的同
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第三章 分子力学的应用科学问题分子结构:蛋白质核酸配体膜表面高分子? 相对能量 – 构象能立体效应 – 溶剂化 – 分子间相互作用 结合能? 异构化能振动频率生成热势能面 势能为分子中原子坐标的函数由原子不同的坐标所得到的势能构成所谓的势能面Local Maxima Global Maximum Loc
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