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生物序列的相似性搜索
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第三章 序列比对和数据库搜索第一节 序列两两比对第二节 多序列比对第三节 数据库搜索引擎——BLAST和FASTA应用比较是科学研究中最常见的方法通过将研究对象相互比较来寻找对象可能具备的特性在生物信息学研究中比对是最常用和最经典的研究手段最常见的比对是蛋白质序列之间或核酸序列之间的两两比对通过比较两个序列之间的
Identification of Peach NAP Subfamily Members Arabidopsis thaliana, Vitis vinifera, and Solanum lycopersicum NAP gene sequences were used to search the peach genome database1 with the NCBI BLASTp to
是进行序列相似性与同源性分析的一种研究方法通过插入一系列空位(一般用-来表示)来比较两个(双序列比对)或多个序列(多序列比对)使得这些序列获得最大匹配的过程Orthologs (?)判 断序列比对图中-表示插入和删除用字符表示相同的残基表示相似残基 …ACTACTGACGCCTGGCATGACGAATCAG ????? ?? ??? TATGAC-AAACAGC 00T5-4-5-1表 B
歌词搜索数据库用来查找歌词或批量查找歌词找到后自动生成结果为标记文本或XML或rtf格式能够兼容word段落样式可供拷贝查找结果参考 HYPERLINK 里面搜索的歌词文本结果可以编辑更改分类管理可以输入新歌词更新数据库附加任务:能在网络上抓取比如百度歌词库或英文歌词库(如果完成可加酬劳)编程平台:MYSQL数据库简单网页界面兼容苹果机safari浏览器系统要求:基本信息:歌名歌手名
序列数据的保存格式与相关数据库资源在数据库中进行序列相似性搜索多序列比对进化树构建与分子进化分析Motif的寻找与序列的模式识别RNA二级结构蛋白质二三级结构的预测基因芯片的数据分析生物序列的相似性相似性和同源性关系Blast简介(一)主要的blast程序蛋白质蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列6框翻译后的蛋白质序列逐一比对底下有其他一些针对特殊数据库的和查看以往的比对结果等其他一些显示格式参数2
第七章:序列比对和数据库搜索Gregory Center for Biotechnology InformationNational Library of Medicine. National Institutes of Health Bethesda. Maryland引言在生物学的研究中有一个常用的方法就是通过比较分析获取有用的信息和知识达尔文正是研究比较了galapagos finches
单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式Blah blah blahLoren ipsumSecond levelThird levelFourth levelFifth levelH I G H Q U A L I T Y. H I G H I M P A C
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