Protein Structure Analysis生 物 信 息 学 导 论Tao Zhang (张涛)Email:zhangtao@生医楼208房间 组成蛋白质的氨基酸种类及个数 蛋白质的基本物理、化学性质 (等电点、亲、疏水性) 蛋白质的功能信息(是否是跨膜 蛋白、是否包含信号肽)蛋白质结构分析的一、二、三β折叠 (sheet)α螺旋(Helix)蛋白质二级结构形式β转角(Turn)无规则卷
Protein Sequence Analysis生 物 信 息 学 导 论Tao Zhang (张涛)Email:zhangtao@生医楼208房间生 物 信 息 学 中的一、二、三(1)蛋白质序列分析 :蛋白质信息分析:序列+结构层次A: 基于序列预测蛋白质特性(基本、特殊)B: 基于序列预测蛋白质功能相关特性(2)蛋白质结构分析 : A: 二级结构:常用的二级结构预测方法 B: 空间结构:三
第三节蛋白质的分子结构 一 蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构(primary structure)是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序。而蛋白质的化学结构包括肽链数目、端基组成、氨基酸序列和二硫键的位置,又称共价结构。蛋白质的一级结构是最基本的结构,它决定着蛋白质高级结构。 一 蛋白质的一级结构以胰岛素为例,胰岛素是动物胰脏中胰岛β细胞分泌的一种分子量较小的激素蛋白,它的主要功能是降低体内血糖含量。临
蛋白质的二级结构 Secondary Structure of Proteins蛋白质具有唯一的化学结构一个经典蛋白质的共价骨架含有数百个化学键,由于围绕这些化学键发生的可能的自由旋转,蛋白质分子可能有无限个空间构象。然而每个蛋白质具有一种特定的化学或结构上的功能,表明每一种蛋白质只有一个唯一的三维结构。1920s后期,几种蛋白质被结晶,包括血红蛋白(Mr 64500)和脲酶(Mr 48300)
蛋白质的一级结构及其分析Peptides and Proteins氨基酸的多聚物,分子量大小差异极大,可以是2或3个到成千上万个氨基酸残基连接而成。两个氨基酸残基之间通过共价的酰胺键(肽键)连接形成一个二肽;三个氨基酸残基连接成三肽;…;有限数量的数十个氨基酸残基连接成寡肽;多个氨基酸残基则连接成多肽;蛋白质可以是成千上万个氨基酸残基连接而成。多肽与蛋白质有时混用,但一般将分子量在10000以下
P58主讲人:卢亚萍蛋白质的二级结构P58蛋白质的分子结构 二 蛋白质的二级结构 二 蛋白质的二级结构虽是单键却有双键性质周边六个原子在同一平面上前后两个a-carbon在对角(trans) 二 蛋白质的二级结构Ca-C 和Ca-N 之间是s 键,可以自由旋转。蛋白质的二级结构指多肽链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。二级结构的概念 二 蛋白质的二级结构天然蛋白质主要二级结构单元包括:
三真核生物基因结构的预测分析1蛋白质理化性质分析 蛋白质理化性质是蛋白质研究的基础分析包括分子质量理论等电点(pI值)氨基酸组成原子组成呈色反应胶体沉淀蛋白质的变形和复性消光系数半衰期不稳定系数脂肪系数和总平均疏水性等分析工具:ProtParam 工具 ProtParam是基于蛋白质序列的组分分析氨基酸亲疏水性等分析为高级结构预测提供参考分析方法(1)查找蛋白质的Swiss-ProtTrEM
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第二节蛋白质的结构组成蛋白质是一类含氮有机化合物除了含有碳氢氧氮以外还含有少量的硫氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分因此可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量由于大多数蛋白质的含氮量接近于16所以可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量:蛋白质含量(克)=每克生物样品中含氮的克数 ? 6.25一 蛋白质的结
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