单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级生物信息学数据库Bioinformatics database一概述?生物信息学的定义 生物信息学是一门交叉科学它包含了生物信息的获取处理存储分发分析和解释等在内的所有方面综合运用数学计算机科学和生物学的各种工具来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义 (美国人类基因组计划实施五年后的总结报告) ??二生物信息学数据库
特殊功能的蛋白质1982啮齿类动物PLNViral未注明来源GSSVERSIONAUTHORS(RAMENT(OC)序列长度GenBank一般不接受50bp以下的记录 KEYWORDS KEYWORDS是一个有趣的历史遗留物NCBI不鼓励使用关键词包含属和种的科学名称 碱基统计信息PubMed is… National Library of Medicines search ser
Click 分子生物学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据 国际上权威的核酸序列数据库 (1)欧洲分子生物学实验室的EMBL (2)美国生物技术信息中心的GenBank (3)日本遗传研究所的DDBJ SWISS-PROT TrEMBL () 是与SWISS-PROT相关的一个数据库包含从EMBL核酸数据库中根据编码序列(CDS)翻译而得到的蛋白质序列并且这些序列
第四章 生物分子数据库主讲人:孙 啸 制作人:刘志华东南大学 吴健雄实验室第一节 引言生物分子数据高速增长 分子生物学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据 建立生物分子数据库 生物分子数据库应满足5个方面的主要需求(1)时间性(2)注释 (3)支撑数据 (4)数据质量 (5)集成性 生物分子数据库 一级数据库数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据只经过简单的归类整理和注释
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级分子生物信息数据库简介一级数据库 直接来源于实验获得的原始数据只经过简单的归类整理和注释 一级核酸数据库:GenBank数据库EMBL数据库DDBJ数据库 一级蛋白质序列数据库:SWISS-PROT库PIR库 一级蛋白质结构数据库:PDB数据库二级
生物分子数据高速增长(6)先进的软硬件配置1.?不断增加?2.?不断修正一级数据库基因组数据库核酸序列数据库蛋白质序列数据库蛋白质结构数据库由美国国立生物技术信息中心(NCBI)维护的一级核酸序列数据库? 这三个数据库是综合性的DNA和RNA序列数据库每条记录代表一个单独连续附有注释的DNA或RNA片段2?基因组数据库???:?(1) 从核酸数据库经过翻译推导而来 (2) 从蛋白质数据库PIR挑
生物信息数据库生物信息数据库产生背景上个世纪60年代以来随着核酸序列测定蛋白质序列测定以及基因克隆和PCR技术的不断发展与完善全世界各研究机构获得了大量的生物信息原始数据面对这些以指数方式增长的数据资源传统的研究方式已经来不及迅速消化因此有必要采用有效的方法将它们进行适当的储存管理和维护以便进一步分析处理和利用这就需要建立数据库即生物信息数据库 ADDIN .{A641E9E8-964C-42A
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级Click to edit Master title styleClick to edit Master text stylesSecond levelThird levelFourth levelFifth level第四章 生物信息数据库4.1 生物信息数据库简介4.1.1 生物信息数据库基本概况4.1.2 生物
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