石墨烯狭缝受限孔道中水分子的分子动力学模拟赵梦尧杨雪平杨晓宁 南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室南京210009 不同狭缝孔道内靠近石墨烯板面水分子的径向分布函数( g O-O ( r )) 物理化学学报201531(8):
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第四章 分子动力模拟计算的原理基本原理牛顿力学方法 (仅适用于直角坐标系)拉格朗日力学方法 (适用于任何坐标系)基本原理哈密顿力学方法(更便于做量子力学和统计力学计算)基本原理系统中任一原子i所受的力为势能的梯度:由牛顿运动定律可得i原子的加速度为:将牛顿运动定律方程式对时间积分可预测i原子经过时间t后的速度与位置牛顿运动力学
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第五章分子动力学模拟 计算的应用本章内容运动轨迹分析热力学特性的计算径向分布函数相关函数的计算运动轨迹分析结构图像 (可视化图形软件)几何参量的时间关系曲线 (graceoriginexcel)键长:键角:二面角:两个面法线的交角法线向量方向:平面内非平行两向量的差乘误差分析 势能函数 可以在计算力的同
左苯丙胺在多巴胺第三受体分子通道中传输分子动力学模拟谢炜徐泽人王明徐四川 云南大学化学科学与工程学院 自然资源药物化学教育部重点实验室 昆明 650091 (A)多巴胺第三受体突变体复合蛋白晶体结构图 (B)人体生物型多巴胺与多巴胺第三受体复合蛋白结构 物理化学学报201632(4):
左苯丙胺在多巴胺第三受体分子通道中传输分子动力学模拟谢炜徐泽人王明徐四川 云南大学化学科学与工程学院 自然资源药物化学教育部重点实验室 昆明 650091 RAT分子沿着 x 轴方向从D 3 R内部结构往细胞双层膜运动轨迹主视图(A)和俯视图(B)和运动轨迹上的自由能势能面(C)及其对应的反应坐标上的伞形样本加权柱状图(D) 物理化学学报201632(4):
Click to edit Master title styleClick to edit Master text stylesSecond levelThird levelFourth levelFifth level第四章 分子动力学模拟方法1957年:基于刚球势的分子動力学法(Alder and Wainwright) 1964年:利用Lennard-Jone势函数法对液态氩性质的模拟(R
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