单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第十章 MC 计算方法MC 模拟-stochastic 模拟动机:从随机的模拟获得平衡的静态的系统性质随机的:系统的构象不遵循运动方程前提:系统的构象遵循一定的统计分布如 Boltzmann分布优点:1)无需计算力 2)对不同的系综均容易执行 3)灵活的随机行走取样MC积分法-随机标靶法 定积分 区内几率 N : 总点数
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级浙江大学研究生学位课程《实用数值计算方法》第七章 常微分方程的数值解法7.1 引言7.2 初值问题解法 7.2.1 单步法7.2.1.1 欧拉法与改进的欧拉法7.2.1.2 龙格-库塔法7.2.1.3 单步法的相容性收敛性与稳定性 7.2.2 线性多步法 7.2.3 微分方程组和高阶微分方程7.3 边值问题解法 7.3.
分子模拟方法 简化计算量 (相对第一性计算而言) 着重于有限温度下体系的性质 观察物质微观运动的细节 计算机虚拟实验联系解析理论与实体实验的桥梁1. 简介. 分子模拟的目的. 平衡统计物理基本概念 势能面(potential energy surface):由不同构型形成的势能的集合系综(ensemble):系统在给定宏观条件下所有状态的集合 两个基本假设:等几率原理与各态历经By Chris
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级分子动力学方法和计算机模拟彭 平Molecular Dynamics method puter simulation什么是分子动力学 分子动力学(MD)模拟就是用计
单击此处编辑母版标题样式title单击此处编辑母版文本样式 words第二级words第三级words第四级words第五级words构象分析方法Conformational Analysis1引言构象分析发展基础 1 Barton1950在取代环已烷反应性的研究中指出反应性受取代分子的赤道或轴向的性质所影响即受取代环已烷构象所影响2 实验技术的引入对分子结构的测定变得可能并且随着能力的提高
单击此处编辑母版标题样式title单击此处编辑母版文本样式 words第二级words第三级words第四级words第五级words第二章 分子模拟中的常用概念1坐标体系(Coordinate systems)笛卡尔坐标(Cartesian coordinates)即用原子的xyz值来表征分子构型如:甲烷分子的笛卡尔坐标表示法 C1 -2.8116
单击此处编辑母版标题样式title单击此处编辑母版文本样式 words第二级words第三级words第四级words第五级words分子模拟原理及应用(二)molecular modellingprinciples and appilications计明娟 2006.91第一章 序言化学就其物质的根本组成来说是由电子及原子核构成的1964年加州大学的Walter Kohn教授和Hohenb
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第六章 长程作用力的计算长程作用力的计算 中央多极展开法 Ewald求和法 作用场与镜像电荷计算法 溶剂介电质模型中央多极展开法分子的各电极分别为: 零极(分子所带的电荷量) 非中性的离子或分子 二极(偶极dipole) 中性的分子如H2O
模拟电子技术基础输入端:反馈信号在输入端的联接分为串联和并联两种方式◆电压控制的电压源◆输入以电压形式求和(KVL)四种类型的反馈组态并联反馈:()(-)(-)反馈通路电流反馈 则iI最好为恒流源即信号源内阻RS越大越好并联反馈判断反馈的组态CERE1:电流串联负反馈RB3?规 律:并联:反馈量
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第四章 分子动力模拟计算的原理基本原理牛顿力学方法 (仅适用于直角坐标系)拉格朗日力学方法 (适用于任何坐标系)基本原理哈密顿力学方法(更便于做量子力学和统计力学计算)基本原理系统中任一原子i所受的力为势能的梯度:由牛顿运动定律可得i原子的加速度为:将牛顿运动定律方程式对时间积分可预测i原子经过时间t后的速度与位置牛顿运动力学
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