#
PCR引物设计的11条黄金法则2006-7-21 8:15:42 信息来源:本站 PCR引物设计的11条黄金法则 生物谷 PCR引物设计的11条黄金法则 1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的在NCBI上搜索不同物种的同一基因通过序列分析 HYPERLINK soft 软件(比如DNAman)比对(Alignment
①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。 ②引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。 ③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。 ④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产
PCR引物设计的11条黄金法则1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的在NCBI上搜索不同物种的同一基因通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment)各基因相同的序列就是该基因的保守区2.引物长度一般在1530碱基之间引物长度(primer length)常用的是18-27 bp但不应大于38因为过长会导致其延伸温度大于74℃不适于
#
引物长度(primer length)产物长度(product length)序列Tm值 (melting temperature)ΔG值(internal stability)引物二聚体及发夹结构 (duplex formation and hairpin)错误引发位点(false priming site)引物及产物GC含量position) 反映了引物
PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段使其能有效地扩增模板DNA序列因此引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否 要设计引物首先要找到DNA序列的保守区同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构如这个区域单链能形成二级结构就要避开它如这一段不能形成二级结构那就可以在这一区域设计引物现在可以在这一保守区域里设计一对引物一般引物长度为1530碱基扩增片段长度为100600碱基对让我们
首先引物要跟模板紧密结合其次引物与引物之间不能有稳定的二聚体或发夹结构存在再次引物不能在别的非目的位点引起DNA聚合反应(即错配)围绕这几条基本原则设计引物需要考虑诸多因素如引物长度(primer length)产物长度(product length)序列Tm值(melting temperature)ΔG值(internal stability)引物二聚体及发夹结构(duplex formati
PCR 引物设计Khorana(1971)等提出在体外经DNA变性与适当引物杂交再用DNA聚合酶延伸扩增DNA的设想1983年Mullis发明了PCR技术使Khorana的设想得到实现1988年Saiki等将耐热DNA聚合酶(Taq)引入了PCR技术1989年美国《Science》杂志列PCR 为十余项重大科学发明之首比喻1989年为PCR爆炸年Mullis荣获1993年度诺贝尔化学奖 5? 5?
1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的在NCBI上搜索不同物种的同一基因通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment)各基因相同的序列就是该基因的保守区 2.引物长度一般在1530碱基之间 引物长度(primer length)常用的是18-27 bp但不应大于38因为过长会导致其延伸温度大于74℃不适于Taq DNA 聚
违法有害信息,请在下方选择原因提交举报