单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第二代基因组测序的原理及其利用沈雨民2011201050前言新一代测序平台第二代基因组测序的利用第三代测序 DNA测序技术早在DNA双螺旋结构发现后不久就有报导当时的测序的方法为降解法(sequencing by degradationSbD)但由于操作复杂并没有形成规模化的应用随后Sanger等发明了具有里程碑式的末端终
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级基因组测序和组装流程生物信息学分析流程图 基因功能注释 基因注释主要基于蛋白序列比对将基因的序列与各数据库进行比对得到对应的功能注释信息 注释的蛋白库为:KEGGCOGSwissProtTrEMBLNRB-6 KEGG代谢通路二级分类图 B-9 KEGG代谢通路二级分类图 B-6 COG功能分类图 B-9 COG功能分类图 B
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第四章 基因组测序及分析 第一节 DNA测序与序列片段的拼接第二节 基因组注释:基因区域的预测第三节 基因组分析第四节 基因组分析举例:水稻基因组分析人类基因组和其它一些生物基因组的大规模测序将成为科学史上的一个里程碑基因组测序带动了一大批相关学科和技术的发展一批新兴学科脱颖而出生物信息学基因组学蛋白质组学等
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级一基因芯片(gene chip)技简介生物芯片(biochip)基因芯片(gene chip DNA chip or DNA microarry)基本概念GeneChip主要是利用Northern blotting的原理将Northern Blotting的探针固定在特定的固体基质上而原来印记在膜上的目标RNA进行标记然后进行
核基因组(3200Mb)<10蛋白编码基因DNA 带负电DNA在电泳胶中的迁移率与其片段大小有关Assembledsequence
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第5章 基因组序列 5.1 物理作图 5.2 基因组测序 5.3 基因组的序列分析 5.4 基因组的序列特征 5.5 生物信息学由来 1900年孟德尔遗传学被重新发现 1905年Bateson定名 遗传学(genectics) 1909年Johannsen提出了基因(gene)一词
临床基因二代测序分析流程临床基因二代数据分析的一般流程1、测序数据质控:1、Fasta格式文件: Fasta格式又叫做Person格式,是最简单的格式,使用最多。 Fasta格式序列以“”引导的序列名称开始,后接序列的详细数据。这一行为描述行。 Fasta格式第一个字符必须是“”字符;随后的行是序列本身,一般每行序列不要超过80个字符,回车符不会影响程序对序列连续性的看法。一个文件可以有多条序
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版
大规模基因组测序的原理与方法胡松年husn@ 元素周期表的发现奠定了二十世纪物理、化学研究和发展的基础元素周期表“基因组序列图”将奠定二十一世纪生命科学研究和生物产业发展的基础! “基因组”----生命科学的“元素周期表”人体解剖图奠定了现代医学发展的基础生命的奥秘蕴藏于 “四字天书”之中…GCTTCTTCCTCATTTTCTCTTGCCGCCACCATGCCGCCACCA TCATTTTCTC
大规模基因组测序的原理与方法胡松年husn@ 元素周期表的发现奠定了二十世纪物理、化学研究和发展的基础元素周期表“基因组序列图”将奠定二十一世纪生命科学研究和生物产业发展的基础! “基因组”----生命科学的“元素周期表”人体解剖图奠定了现代医学发展的基础生命的奥秘蕴藏于 “四字天书”之中…GCTTCTTCCTCATTTTCTCTTGCCGCCACCATGCCGCCACCA TCATTTTCTC
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