单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第四章 基因组测序及分析 第一节 DNA测序与序列片段的拼接第二节 基因组注释:基因区域的预测第三节 基因组分析第四节 基因组分析举例:水稻基因组分析人类基因组和其它一些生物基因组的大规模测序将成为科学史上的一个里程碑基因组测序带动了一大批相关学科和技术的发展一批新兴学科脱颖而出生物信息学基因组学蛋白质组学等
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第二代基因组测序的原理及其利用沈雨民2011201050前言新一代测序平台第二代基因组测序的利用第三代测序 DNA测序技术早在DNA双螺旋结构发现后不久就有报导当时的测序的方法为降解法(sequencing by degradationSbD)但由于操作复杂并没有形成规模化的应用随后Sanger等发明了具有里程碑式的末端终
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第5章 基因组序列 5.1 物理作图 5.2 基因组测序 5.3 基因组的序列分析 5.4 基因组的序列特征 5.5 生物信息学由来 1900年孟德尔遗传学被重新发现 1905年Bateson定名 遗传学(genectics) 1909年Johannsen提出了基因(gene)一词
Mauve基因分子进化分析步骤加至8ml 1X SSC搅拌10min重复一次取8支试管按实验指导的表格加入试剂加毕置沸水浴10分钟取出冷却以0号管(空白管)调零点于595nm波长比色以光密度为纵坐标DNA含量(μgml)为横坐标绘制标准曲线.将实验中所得到的兔肝DNA溶液作为待测样品取两只试管分别标U和B按表加入试剂混匀置沸水中10min 取出冷却在595nm处以B管调零测得待测液的光密度值从标准
单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级第九章 基因组序列诠释问题基因组序列所包含的全部遗传信息是什么基因组作为一个整体如何行使其功能用什么方法寻找基因研究基因地功能呢主要内容:寻找基因获取基因的全长cDNA序列确定DNA顺序中基因的位置研究基因的功能基因表达蛋白质组学1. 寻找基因1.1 根据开放读码框预测基因A 起始密码子 ATG第一个ATG的确定则依据Koza
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单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级基因组测序和组装流程生物信息学分析流程图 基因功能注释 基因注释主要基于蛋白序列比对将基因的序列与各数据库进行比对得到对应的功能注释信息 注释的蛋白库为:KEGGCOGSwissProtTrEMBLNRB-6 KEGG代谢通路二级分类图 B-9 KEGG代谢通路二级分类图 B-6 COG功能分类图 B-9 COG功能分类图 B
细胞内的一种形态结构易被碱性染料染成深色由核酸和蛋白质组成 基因组(genome)(P10) 基因组计划复旦大学图书馆文献检索教研室① 基因组较小通常由一条环状双链DNA(double stranded DNAdsDNA)分子组成 ④ 基因连续基因内没有内含子(古细菌除外)质粒(plasmid)二质粒二质粒3质粒的分类复制机制 严紧型 松弛型 功能 F质粒(性质粒)
核基因组(3200Mb)<10蛋白编码基因DNA 带负电DNA在电泳胶中的迁移率与其片段大小有关Assembledsequence
第六章 遗传和变异基础知识梳理诱发突变三基因重组1.概念指生物体进行__________的过程中控制不同性状的基因的___________2.基因重组的类型(1)随着非同源染色体的自由组合导致非同源染色体上的___________自由组合(2)随着同源染色体上的非姐妹染色单体的交换______基因发生变换__________上的非等位基因重新组合思考2.在真核生物中基因突变和基因重组对生物多
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